程莘农认为，医生临床要以病人为本，不仅要重视疾病，更要关心病人。在患者体位、针具选择、进针方法、针刺深浅等方面，既要确保疗效，又要注意患者能否接受，尤其是初次接受针灸治疗的人，进针的快慢、是否疼痛等因素，直接影响针灸的疗效。所以方便操作和快速熟练的进针方法，是成功的关键。根据多年临床经验，程莘农总结出了“程式三才进针法”。
掌握针具尺寸，区分材质
选择针具要根据患者年龄、性别、职业、体质、病情等方面情况考虑，选择适当粗细、长短的针灸针。一般来说老人、小孩、女性、体质弱或慢性病患者宜用较细、较短的针，反之则用较长的针具。
选择适当的体位，有利于腧穴的正确定位，便于针灸的施术操作和较长时间的留针，同时可避免针刺以后发生意外。临床上常用的体位有：仰卧位、俯卧位、侧卧位、仰靠坐位、俯伏坐位、侧伏坐位。
针灸针分为针尖、针身、针根、针柄、针尾。规格有上百种型号。以粗0.3～0.35mm，长25～75mm的针具最为常用。针体必须光滑锋利、挺直，易于进针,手感好。针尖应具有“尖中带圆，圆而不钝”的特点，必须达到刺棉花拔出不带纤维,挑木板不起毛勾的境地，施针痛感才小。针柄针体连接牢固，否则容易断针。进针后针柄必须与皮肤留有3.5～6.5mm距离，避免进针太深，针尖受损，针身容易弯曲导致断针的发生。
掌握进针方法，推崇“三才”
程莘农强调，针灸治疗时，进针手法的好坏关系到针灸的治疗效果。《灵枢·九针十二原》：“持针之道，坚者为宝。”程莘农强调持针要有“手如握虎”之力，方能“伏如横弓，起如发机”，进针时指力和腕力必须配合好，悬指，悬腕，悬肘，切循经络，针随手入。他在长期的医疗教学实践中，总结出了一种易学、易教、令病人痛苦小的进针法，取名为“程式三才进针法”，取意天、人、地三才，即是进针时分皮肤、浅部和深部三个层次操作，先针3.5～6.5mm深，通过皮肤的浅部，为天才，再刺16～20mm深，到达肌肉为人才，三刺10～13mm深，进入筋肉之间为地才，然后稍向外提，使针柄与皮肤之间留有一定间距。
如此进针，轻巧迅速简捷，由浅入深，逐层深入，得气迅速。一则减少患者的疼痛，二则可以调引气机之升降。进针讲究指实腕虚，专心致志，气随人意，方使针达病所，气血和调，正胜邪去。这一刺法吸取了中国传统针法与管针进针法的长处，仅进针这一操作，将点穴、押指、穿皮、送针等动作揉和一起，在1～2秒钟内完成，得气（感觉）极为迅速而效果良好，具有快速无痛、沉稳准确的优点。
“程式三才进针法”的练习,主要是对指力和手法的锻炼。由于毫针针身细软，如果没有一定的指力，就很难力贯针尖，减少刺痛，对各种手法的操作，也不能运用自如。因此针刺练习，必须进行指力练习（纸垫练针法）、手法练习（棉团练针法）和自身练针，才能掌握基本技能。进针时既以浅、中、深“三才”为主，又要仔细体会手法与针感的关系、针尖刺达不同组织结构以及得气时持针手指的感觉，并要求做到进针无痛、针身不弯、刺入顺利、行针自如、指力均匀、手法熟练、指感敏税、针感出现快。
掌握针刺深浅，因人而异
程莘农认为针刺浅深问题，是毫针刺法的重要技术指标之一，直接决定疗效。但是，决定针刺浅深的因素是多方面的。总的来说，病情是决定针刺浅深的关键，腧穴所在部位是决定针刺浅深的基础，患者年龄、体质是决定针刺浅深的重要条件。如治疗外感表证时刺风池宜浅，进针7～12mm即可，而治中风语言謇涩之里证则深刺风池，可直刺达20～30mm。寒性胃痛刺中脘进针深，而热性胃痛则浅刺之。腹腰、四肢内侧等阴部腧穴刺之宜深，头面、胸背、四肢外侧等阳部腧穴刺之宜浅。
总之，在掌握针刺浅深时，要因病、因穴、因人而宜，既要与患者年龄、体质相适应，又要与病情属性相适应。否则，就会产生深则邪气从之入，浅则邪气不泻的后果。