艾灸的方法以艾炷灸和艾条灸最为常用，是灸法的主体部分。在使用艾炷灸时，根据艾炷是否直接置于皮肤穴位上燃灼的不同，又分为直接灸和间接灸；而艾条灸也根据是否与皮肤接触，分为悬起灸和实按灸。
艾炷灸
将艾炷放在穴位上施灸，称为艾炷灸。艾炷灸可分为直接灸和间接灸两种。
一、直接灸
将艾炷直接放在皮肤上施灸的方法，称为直接灸。根据灸后有无烧伤化脓，又分为瘢痕灸和无瘢痕灸。
（1）瘢痕灸 又称化脓灸、烧灼灸。艾炷直接放在穴位上施灸，局部组织经烫伤、溃破、化脓，留永久瘢痕。
方法是①点穴：因施治时间较长，疼痛剧烈，要求体位平正、舒适。待体位摆妥后，可用圆棒蘸龙胆紫或用墨笔在穴位上划点标记。②施灸：首先按要求制作好艾炷，除单纯采用细艾绒外，也可在艾绒中加入一些芳香性药末，如丁香、肉桂（丁桂散）等，有利于热力的渗透。然后，在施灸的穴位处图以少量的葱汁或凡士林，以增强粘附和刺激作用，一般可灸7-9壮。③敷贴药膏：灸治完毕后，应将局部擦拭干净，然后在施灸穴位上敷贴玉红膏或创可贴，可1-2日换贴1次。在使用化脓灸时，局部应注意清洁，避免污染，以免并发其他炎症。
（2）无瘢痕灸 又称非化脓灸，施灸以温熨为主，不致透发成灸疮，不留瘢痕。
方法是先将施灸部位涂以少量凡士林，然后将小艾炷放在穴位上，并将之点燃，不等艾火烧到皮肤，当患者感到灼痛时，即用镊子将艾炷夹去或压灭，更换艾炷再灸，连续灸3-7壮，以局部皮肤出现轻度红晕为度。因其不留瘢痕，易为患者接受。
二、间接灸
又称间隔灸或隔物灸，指在艾炷下垫一衬隔物放在穴位上施灸的方法。因其衬隔药物的不同，又可分为多种灸法，衬隔物常用的有姜、盐、蒜。因其火力温和，具有艾灸和药物的双重作用，患者易于接受。
（1）隔姜灸 将新鲜生姜切成约0.3厘米厚的薄片，中心处用针穿刺数孔，上置艾炷，放在穴位上，当患者感到灼痛时，可将姜片稍许上提，使之离开皮肤片刻，旋即放下，再行灸治，反复进行。生姜味辛，性微温，具有解表、散寒、温中、止呕的作用，故此法多用于治疗如感冒、咳嗽、风湿痹痛、呕吐、腹痛、泄泻等病症。
（2）隔蒜灸 用独头大蒜切成约0.3厘米厚的薄片，中间用针穿刺数孔，放在穴位或患处，每穴一次可灸5-7壮。因大蒜液对皮肤有刺激性，灸后容易起泡，故应注意防护。大蒜味辛，性温，有解毒、健胃、杀虫之功，本法多用于治肺痨、腹中积块及未溃疮疖等病症。
（3）隔盐灸 又称神阙灸，本法只适于脐部。患者仰卧屈膝，以纯白干燥的食盐，填平脐孔，再放上姜片和艾炷施灸。如患者脐部凸出，可用湿面条围脐如井口，再填盐于脐中，如上法施灸。该方法对急性腹痛、吐泻、痢疾、四肢厥冷和虚脱等证，具有回阳救逆之功。
（4）隔附子（饼）灸 以附子片或附子饼（将附子切细研末，以黄酒调和作饼，厚约0.3厘米，直径约2厘米）作间隔，上置艾炷灸之。由于附子辛温火热，有温肾补阳的作用，故用来治疗各种阳虚证，如阳萎、早泄以及外科疮疡窦道盲管，久不收口，或既不化脓又不消散的阴性虚性疮疡。
此外，还可以用豆豉饼、胡椒饼、黄土、核桃壳、面粉作为衬隔物施灸，方法同前，但功效各异。
艾条灸
艾条灸是艾灸法的一种，其用特制的艾条在穴位上薰灸或灼烫的方法。如在艾绒中加入辛温芳香药物制成的药艾条施灸，称为药条灸。艾条灸有悬起灸和实按灸两种。
一、悬起灸
悬起灸是将点燃的艾条悬于施灸部位之上的一种灸法。一般艾火距皮肤约3厘米,灸10-20分钟，以灸至皮肤温热红晕，而又不致烧伤皮肤为度。按悬起灸的操作方法又可分为温和灸、回旋灸和雀啄灸。
（1）温和灸 将艾卷的一端点燃，对准应灸的腧穴部位或患处，距离皮肤2-3厘米进行熏烤，使患者局部有温热感而无灼痛为宜，一般每穴灸10-15分钟，至皮肤红晕为度。如遇到昏厥或局部知觉减退的患者及小儿时，医者可将食、中两指置于施灸部位两侧，这样可以通过医生的手指来测知患者局部受热程度，以便随时调节施灸距离，掌握施灸时间，防止烫伤。此法适用于各种病证。
（2）雀啄灸 将艾卷点燃的一端与施灸部位的皮肤并不固定在一定的距离，而是像鸟雀啄食一样，一上一下地移动。用于治疗小儿疾病或急救晕厥等。
（3）回旋灸 将艾卷点燃的一端与施灸皮肤保持在一定的距离，但位置不固定，而是均匀地向左右方向移动或反复旋转地进行灸治。适用于风湿痹痛、神经性麻痹及病变面积较大的皮肤病等。
二、实按灸
旋灸时，先在施灸腧穴或患处垫上布或纸数层，然后将药物艾卷的一端点燃，趁热按到施术部位上，使热力透达深部。待火灭热减后，再重新点火施灸，每穴可按灸几次至几十次。根据艾绒里掺入的药物不同，又分为太乙神针、雷火神针、百发神针等。
太乙神针：含有檀香、山柰、羌活、桂枝、木香、雄黄、白芷、细辛等药物的艾条。
雷火神针：含有沉香、木香、乳香、茵陈、羌活、干姜、穿山甲、麝香等药物的艾条。
百发神针：含有乳香、没药、生川附子、血竭、川乌、草乌、檀香末、降香末、大贝母、麝香、母丁香的艾条。