子宫内膜异位症以妇人下腹疼痛，甚则痛连腹胁，经期加重为主要症状。现代医学认为该病是由于异位内膜在女性激素的周期作用下，增生—分泌—脱落出血所致，异位内膜出血而血无出路，积聚在某一部位，刺激局部组织所形成。
异位内膜所出之血，即中医所谓的“离经之血”。其积聚成瘀，成为致病因素，故中医认为“瘀”是产生子宫内膜异位症的关键，故活血化瘀是治疗的基本原则。
子宫内膜异位症属祖国医学“痛经”、“癥瘕”的范畴。《金匮·妇人杂病》早有：“经水不利，少腹满痛”的记载。《医学入门》也云：“血滞瘀积于中，与日生新血相结搏则为疼痛。”清·王清任著《医林改错》言少腹逐瘀汤：“此方治少腹积块疼痛，或有积块不疼痛，或疼痛而无积块或少腹胀满”，其所论述与今子宫内膜异位症症状颇相近似。
中医对子宫内膜异位症的治疗，活血化瘀为基本原则，常辨证分为以下几种类型：
气滞血瘀型：中医认为气为血帅，血为气母，气行则血行，气滞则血瘀，气血阻滞致使冲、任、督、带之气血不能通畅，不通则痛。本证常见脘腹痞胀且痛，痛连胁肋乳房的下腹痛为主，多痛甚于胀，常伴有面色黧黑或舌有瘀斑，脉弦或涩。
血府逐瘀汤是治疗气滞血瘀的主方，方内柴胡、枳壳、白芍、甘草组成的四逆散，以疏肝理气行气止痛，另当归、川芎、赤芍、熟地、桃仁、红花组成的桃红四物汤以活血化瘀，有行瘀之功。加桔梗载药上行，牛膝活血破瘀共起理气活血止痛作用。临症腹痛剧烈常合失笑散，瘀血成块加三棱、莪术，瘀热便秘适加大黄、芒硝，瘀久入络则加全蝎、蟅虫等品。
寒凝瘀阻型：阴寒之邪客于胞宫、胞脉，搏结于内与血结，阻滞脉络，冲任之气不利，不通则痛。患者症见少腹冷痛，遇热则减，治以温经散寒、活血祛瘀止痛，常用少腹逐瘀汤加减。
方用当归、川芎、干姜、肉桂温经散寒，失笑散元胡祛瘀止痛，小茴香温经理气，没药定痛。腹痛剧烈可适加乌头、形寒肢冷加附子，伴恶心呕吐加吴茱萸。若症见冲任虚寒，瘀血阻滞，可以《金匮》温经汤养血活血止痛。
气虚瘀阻型：素体虚弱，气血不足，气虚则血行无力，血行不畅，瘀血停滞使新血不生，气血更弱。此类患者多病程长，腹痛多喜按，常伴有头晕目眩，神疲乏力，少腹坠胀，舌质淡胖，边有齿印，或青紫胖大，六脉细软无力。
治疗当以益气行气，活血化瘀，攻补兼施，常选用黄芪建中汤、当归建中汤、附子理中汤之类，加入活血化瘀之品，也可用补中益气汤加活血祛瘀之品。
热郁瘀阻型：瘀血积久，郁而化热，邪热阻塞脉道，热与瘀互为因果，故此类病人多腹痛剧烈而伴有经期发热，口渴，便秘，烦躁。临床可选用小柴胡汤合桂枝汤和解泄热，祛瘀消积。若腹痛而兼肠胃实热便秘为主者，可用桃仁承气汤，破血祛瘀、软坚消积。