督脉起子长强穴，出于会阴部，来到体表在尾骨沿脊背上行，直到头部，从百会穴向下直到头顶、额头，至口里的龈交穴。另有一支上行至前额，于巅顶交会入络于脑，再出下项，沿肩胛骨内，脊柱两旁，到达腰中，进入脊柱两侧的肌肉与肾脏相联络。
督脉的交会腧穴有长强穴、陶道穴、大椎穴、哑门穴、风府穴、脑户穴、百会穴、水沟穴、神庭穴。督脉与脑相连，督脉有问题就会项背僵直、牙关紧闭、头痛、四肢抽搐，甚则神志昏迷、发热。督脉与肝肾关系密切，督脉不通就会头昏头重、眩晕、健忘；两耳通于脑，脑髓不足则耳呜耳聋。主治热病、疟疾、咳嗽、喘逆、项僵、肩背痛、腰脊僵、角弓反张、小儿惊风、癫狂痫症、五劳虚损、七伤乏力、中暑、霍乱、呕吐、黄疸、风疹、昏迷、发热等。
