张仲景《伤寒论》以四时阴阳为大纲通论全书，首先表现在一日或一年四时分上。
寅申春夏阳仪和秋冬阴仪分
张仲景紧抓四时阴阳之理，以四时阴阳为据展开了《伤寒论》的论述。
《素问·阴阳应象论》说：“天以阳生阴长，地以阳杀阴藏。”这就是天地四时阴阳生杀之理。可以从此理会出《伤寒论》六经病欲解时的道理。春夏“阳生阴长”称为“阳仪系统”，秋冬“阳杀阴藏”称为“阴仪系统”。
从六经病欲解时图可以看到，从寅到未上半年春夏阳仪系统主太阳、少阳、厥阴三经（即伤寒、中风、温病三证），称之为阳仪，《伤寒论》有阳仪太阳少阳合病、并病；从申到丑下半年秋冬阴仪系统主阳明、太阴、少阴三经（即宋本《辨痓湿暍病脉证第四》三证）。充分体现了张仲景《伤寒论》是以四时阴阳理论为大纲的，其撰用《阴阳大论》，名不虚传。五运六气理论中司天主上半年阳仪系统，在泉主下半年阴仪系统，所以两仪分与运气理论有密切关系（见图1）。
1．阳仪三经三气所致太阳病
六淫皆由表部侵犯人体，故六淫皆有太阳表证，张仲景按阳仪、阴仪分为两类，阳仪三邪为寒、风、火，阴仪三邪为燥、湿、热，所以我们也按两仪分之。
从《伤寒论》六经病欲解时图可以看出，主上半年春夏阳仪系统的三经是太阳、少阳、厥阴，经言：太阳之上，寒气主之；少阳之上，相火主之；厥阴之上，风气主之。所以太阳感受这三邪就成为太阳伤寒、太阳中风、太阳温病三大类病证。
2．阴仪三经三气所致太阳病
阴仪由阳明、太阴、少阴组成。经云：阳明之上，燥气主之；太阴之上，湿气主之；少阴之上，热气主之。所以外感燥、湿、热三气也必伤太阳，热气所伤称为太阳中热（或称中暍），湿气所伤称为太阳湿痹，燥气所伤称为太阳痉病（或称痓病）。只因这三气属于阴仪系统，不属于阳仪系统，故《辨痉湿暍脉证篇》说：“伤寒所致太阳病，痓、湿、暍三种，宜应别论，以为与伤寒相似，故此见之。”其“伤寒所致太阳病”中的“伤寒”是指广义伤寒，所以痓、湿、暍三种包括其中。而“与伤寒相似”中的“伤寒”是指寒邪所致之伤寒。《医宗金鉴》说：“伤寒，太阳经中之一病，非谓太阳经惟病伤寒也。盖以六气外感之邪，人中伤之者，未有不由太阳之表而入者也。……夫风寒暑湿之病，固皆统属太阳，然痉、湿、暍三种，虽与伤寒形证相似，但其为病传变不同，故曰‘宜应别论’之。”因为痉、湿、暍三邪属于阴仪系统，传变途径及传变规律都不同阳仪风、寒、火三邪，所以“宜应别论”。
伤寒与温病之争激烈而久矣，近来则有人提出寒温统一论，其实如果明白了“病发于阳”、“病发于阴”之后，就没有争的必要了，因为《伤寒论》就是寒温统一的，麻黄汤是太阳阳明合病伤寒证，白虎汤是三阳合病温病证，寒温之争不过是“世上本无事，庸人自扰之”而已。《伤寒论》只是论伤寒详而论温病略罢了。
辰戌夏秋“病发于阳”
和冬春“病发于阴”分
《素问·金匮真言论》说：“冬病在阴，夏病在阳，春病在阴，秋病在阳……故背为阳，阳中之阳心也；背为阳，阳中之阴肺也；腹为阴，阴中之阴肾也，阴中之阳肝也；腹为阴，阴中之至阴脾也。”这就是说，夏秋病在阳，冬春病在阴。夏秋病在阳属于心肺系统发病，候于背，在表，故《伤寒论》第7条说“发热恶寒者发于阳”。冬春病在阴属于脾土系统发病，候于腹，在里，故《伤寒论》第7条说“无热恶寒者发于阴”。其实，这是以横膈膜分上下天地阴阳：心肺在膈上为阳为天，主背；脾土类及肾在膈下为阴为地，主腹。界于天地之间的横膈膜，乃肝胆部位。
“病在阳”，《伤寒论》称作“病发于阳”，多属于外感病。“病在阴”，《伤寒论》称作“病发于阴”，属于外感直中者，亦多内伤病。故张仲景称作《伤寒杂病论》。所以柯韵伯称《伤寒论》统治百病。
寅申春夏和秋冬阴阳两仪分界线位于易学中的人门和鬼门，辰戌“病发于阳”和“病发与阴”分界线位于易学中的天门和地户。
1．病发于阳
“病发于阳”属于夏秋心肺太阳阳明病系统，论述于《伤寒论》中的太阳病中篇，即太阳阳明合病、并病，有麻黄汤证和葛根汤证等，以及其误治诸证。
2．病发于阴
“病发于阴”属于冬春太阴、少阳、少阴、厥阴系统，有外感直中和内伤之分，多太阴少阴合病、并病，论述于《伤寒论》中的少阴、厥阴篇。
3．误治证
“病发于阳”和“病发于阴”最多误治证，如结胸和痞证，论述于《伤寒论》中的太阳病下篇。
合病并病
《素问·六元正纪大论》说：“岁半以前，天气主之；岁半以后，地气主之。”岁半以前是春夏阳仪系统，天气者肺主之，肺为阳明，而夏秋属于太阳阳明在横膈膜之上天之分，所以厥阴、少阳、太阳阳仪系统和“病发于阳”、“病发于阴”之分上焦的太阳阳明都属于大表部。所以在太阳病篇可以见到少阳病（大小阳旦汤证、大小阴旦汤证及白虎汤证）和厥阴病（刺期门、肝俞）。
岁半以后是秋冬阴仪系统，地气者太阴脾土主之，《素问·六节藏象论》说：“脾、胃、大肠、小肠、三焦、膀胱者……此至阴之类，通于土气。”而《素问·五脏别论》说：“夫胃、大肠、小肠、三焦、膀胱，此五者天气之所生也，其气象天，故泻而不藏。”《素问·阴阳应象大论》说：“天气通于肺。”故知“天气”者可以引发“地气”类发病。然三焦膀胱者应于毫毛腠理，少阳三焦不升又可以引发“天气”类发病。
医家对于《伤寒论》中的太阳阳明合病、并病以及太阳少阳合病、并病不理解，所以有一些《伤寒论》教材把合病、并病放置到备考文中了。合病，同时发病也。并病，一经未罢而传另一经也。从六经病欲解时图可以看得清清楚楚，太阳逆时针方向连接少阳同属于纵向春夏阳仪系统之表，故有太阳少阳合病、并病；太阳顺时针方向连接阳明同属于横向上焦之表，病在阳在背，故有太阳阳明合病、并病。
两仪分把外感病分为风寒伤阳、风热伤阴及湿热伤中道三大类型，并会产生太阳少阳并病、合病。
“病发于阳”、“病发于阴”分则分为外感和内伤两大类，太阳阳明主外主表，统一切外感之病，并会产生太阳阳明并病、合病（见图2）。
卯酉昼夜分
《伤寒论》里多次提到昼夜分，其理论依据是卫气昼行于阳、夜行于阴，从六经欲解时图可以看出，三阳主昼，三阴主夜。如《伤寒论》第30条说“夜半阳气还”，第61条说“昼日烦躁”，《伤寒论·辨脉法》说“夜半”、“日中”、“五月”、“十一月”。
五月之时，阳气在表，胃中虚冷，以阳气内微，不能胜冷，故欲著复衣；十一月之时，阳气在里，胃中烦热，以阴气内弱，不能胜热，故欲裸其身。
假令夜半得病者，明日日中愈；日中得病者，夜半愈。何以言之？日中得病，夜半愈者，以阳得阴则解也。夜半得病，明日日中愈者，以阴得阳则解也。
小结：《伤寒论》昼夜分人人知之，我们在这里揭开了《伤寒论》四时分中的最大秘密，那就是阳仪、阴仪和病发于阳、病发于阴之分，张仲景以此为纲领通论《伤寒论》，纲举目张，持简驭繁，如此圣明之论，却被湮没无闻近两千年，难道不是《伤寒论》之悲哀！我将此寅申阳仪阴仪分、辰戌“病发于阳”和“病发于阴”分及卯酉昼夜分称作《伤寒论》三分法理论，简称“三分理论”，乃《伤寒论》通论大法，不明此“三分理论”，难懂《伤寒论》。
明白了《伤寒论》四时分奥秘，就明白了《伤寒论》是寒温统一的，并通治外感和内伤。
我们通过对《伤寒论》六经病欲解时的解读，可以清楚地看到张仲景承用《素问》、《九卷》、《八十一难》、《阴阳大论》及“天布五行，以运万类，人禀五常，以有五脏”的内容，怎么能说《伤寒论》理论不是直接来源于《内经》呢？怎么能说张仲景不是创作《伤寒论》，只是收集处方并记载保存而已呢？