选择表里经作为治疗经脉，分为阳病取阴、阴病取阳和阴阳经并取三种。当阳经反应的症候出现虚弱或寒证的表现，或者阳经本身经络反应出现虚弱或寒证的现象，取相表里的阴经治疗。当阴经出现实证热证时，可以选用相表里的阳经泻实清热。
对于疾病复杂，既有正虚又有邪实，可以阴阳经并取。当正气虚作为主要因素，可取阴经补虚温阳益气，同时配伍相表里的阳经腧穴泻实清热。当邪气实作为主要因素，可取阳经泻实清热，同时配伍相表里的阴经腧穴，在驱邪同时扶正，补充元气。
王居易教授是北京中医药薪火传承“3+3”工程专家。他认为，针灸治疗的辨证方法不应该完全等同于中医内科的辨证方法，应建立以经络理论为指导的针灸治疗学体系，提出将针灸治疗过程概括为察经、辨经、选经、配穴、手法五部分；在对患者情况有了客观、全面了解后，将主症症候与经络异常表现相对接，判断病变经脉，并根据经络气化理论及经络主治病候等选择合适的治疗经脉,再根据腧穴的性质和经脉的状态选择合适的腧穴和手法。
笔者在跟师过程中深刻体会到，王居易经络医学理论的临床实用性；虽表面繁琐、难以掌握，但逻辑性强，一旦掌握，则触类旁通，一法生万法。王居易经络理论体系并非高不可攀，只要下工夫，每个临床医生都能够掌握。笔者在此简要介绍其选经理论，与同道探讨。
选经的依据
选经理论是王居易经络医学理论体系的重要组成部分。他认为，选经的理论依据主要是：十二经脉及其所联属脏腑管辖调节的生理病理功能；《灵枢·经脉》《素问·骨空论》《难经》记载的十二经、奇经八脉的主治病候；经脉、络脉、经别、经筋的循行及生理功能。
另外，如果没有通过经络诊察和询问症候获得准确的临床资料，并准确地辨别出病变经脉，那么所选择的治疗经脉也不一定是准确的。
病变经脉不能等同治疗经脉
许多针灸医生认为哪条经脉有问题就选择哪条经脉进行治疗。王居易认为病变经脉不完全等同于治疗经脉，更不是简单地只将压痛点或阳性反应点作为治疗的穴位。由于经脉气血循行的相关性，一条经脉的异常不一定是本经的问题，也可能是受到其他经脉脏腑的影响所致。对于一些病史短、病情轻、病候单一、其他脏腑功能好的疾病，可以选择病变经脉作为治疗经脉。
然而，对于病机较复杂、病史较长、病变涉及到多条经脉的疾病，仅仅选择病变经脉作为治疗经脉是不够的，需要仔细分析各个经脉的气化作用及相互关系，选择合适的治疗经脉。王居易认为，将病变经脉等同于治疗经脉的认识极大影响了针灸的治疗效果及针灸理论的发展。
选经取穴并非越多越好
目前有很多针灸医生治疗动则二三十针，认为选穴越多效果越好。
例如咽痛咳嗽，如果仅仅是手太阴肺经的问题，通过少商放血，针刺尺泽就可以解决。然而常规治疗时往往加上丰隆、大椎、曲池、足三里，原则上看无大碍，但从长远看对经络没有好处。
因为经络气血按自身规律运行，尽量不要过多干扰，不要做无意义的耗损和刺激。本来阳明经没有问题，多针刺这些穴位就会耗损阳明经的阳气。偶然干扰一下，还可通过自身进行调节，但长此以往，尤其手法比较重的干扰，可能会造成经络疲劳而出现不可预见的后果。
笔者临床就曾遇到一些接受过长期大量经络刺激的患者，针感非常差，针灸效果不理想，需要经过一段时间调整经络才能逐渐恢复针感。
选经配穴过多也会相互干扰，影响治疗效果。如一老年女性失眠患者，因多处就诊，很多穴位都被针刺过，针后有疲劳感，却不能入睡。笔者经络诊察为太阳、少阴经异常，取针刺前顶、天柱、双神门、照海，灸大椎。当时患者还嫌取穴少，要求多扎几针；但针后当晚睡眠明显改善，经一段疗程后基本能自行入睡，睡眠质量亦有改善。
笔者体会，取穴多而杂恰恰是对诊断不自信的表现，盲目多取穴没有益处，反而相互矛盾，造成危害。因此，需要在准确察经、辨经基础上，选择最合适的治疗经脉。
选经五法
王居易总结出许多种选经方法，主要有以下五种：一是选择病变经脉本经；二是选择表里经；三是选择同名经；四是根据五行生克制化关系选经；五是选择奇经八脉。笔者通过以下病例简要说明。
病例
苏某，女，41岁。2012年12月4日初诊。
患者右肩疼痛3~4年。以右肩前部痛为主，活动有弹响，外展时有“嵌顿”感，曾在西医院诊断为“肩袖损伤”，接受多次针灸及西医治疗，甚至被建议手术治疗。
察经：右手太阴经经渠有结络，尺泽有结节，病变经脉为手太阴经，给予揲右侧经渠、尺泽、中府各7~10次，患者感肩前部疼痛及弹响即刻减轻，又治疗两次痊愈。
按：这是选择病变经脉本经治疗的典型病案。目前很多针灸医生治疗颈肩部疾病经常选取很多局部阿是穴，有的可能将三阳经都取遍，疗效也不一定理想。
王居易认为，选择病变经脉本经作为治疗经脉主要针对一些病史短、病情轻、病候单一的疾病，主症与病变经脉对接完全，而非他经他脏腑影响所致。选择病变经脉作为治疗经脉可以避免对其他经脉不必要的刺激，治疗更有针对性。